MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Helicobacter mustelae 12198 chromosome

Total Repeats: 4288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013949	T	7	7	1296	1302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013949	CAAAA	2	10	1339	1348	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_013949	CTA	2	6	1408	1413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013949	TAC	2	6	1415	1420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013949	TAT	2	6	1429	1434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013949	AAAGG	2	10	5754	5763	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013949	ATT	2	6	5769	5774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013949	TA	3	6	5778	5783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013949	GCT	2	6	5784	5789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013949	AAT	2	6	5821	5826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013949	AGA	2	6	5868	5873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013949	TGAT	2	8	5896	5903	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013949	CTG	2	6	5909	5914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_013949	TAA	2	6	5920	5925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013949	AAAT	2	8	5968	5975	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013949	A	7	7	6043	6049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013949	GCTT	2	8	6051	6058	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_013949	GA	3	6	6097	6102	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013949	TGT	2	6	6171	6176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013949	AAT	2	6	6187	6192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013949	TCT	2	6	6205	6210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_013949	TG	3	6	6268	6273	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013949	GTA	2	6	6277	6282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013949	AAT	2	6	6351	6356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013949	TAGGA	2	10	6379	6388	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013949	AG	3	6	6409	6414	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013949	TGTTTT	2	12	6441	6452	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013949	GTT	2	6	6476	6481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013949	GTTT	2	8	6489	6496	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013949	T	6	6	6494	6499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013949	GCA	2	6	6529	6534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_013949	TAAG	2	8	6537	6544	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013949	AAG	2	6	6558	6563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013949	CTC	2	6	6571	6576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_013949	ACAAA	2	10	7619	7628	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_013949	TTTTA	2	10	7634	7643	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013949	ATT	2	6	7657	7662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013949	TAA	2	6	7677	7682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013949	ATA	2	6	7744	7749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013949	T	6	6	7775	7780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013949	GAG	2	6	7786	7791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013949	GA	3	6	7924	7929	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013949	T	6	6	7964	7969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013949	T	6	6	7977	7982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013949	T	6	6	7988	7993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013949	T	6	6	8022	8027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013949	AGG	2	6	8038	8043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013949	A	6	6	8063	8068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013949	TTTG	2	8	9086	9093	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013949	A	6	6	9113	9118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013949	A	6	6	9151	9156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013949	TCCT	2	8	10232	10239	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_013949	TATTTT	2	12	13504	13515	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013949	A	7	7	13527	13533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013949	AGA	2	6	15118	15123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013949	C	6	6	15163	15168	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
57	NC_013949	T	7	7	15192	15198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013949	CCA	2	6	15245	15250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_013949	T	6	6	21595	21600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013949	CCT	2	6	22343	22348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_013949	CTTG	2	8	22367	22374	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_013949	C	11	11	22390	22400	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
63	NC_013949	T	7	7	22424	22430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013949	ATT	2	6	22460	22465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013949	TC	3	6	22477	22482	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_013949	AAAG	2	8	22505	22512	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013949	CTTTT	2	10	22535	22544	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_013949	CTTTGA	2	12	22605	22616	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_013949	CTTT	2	8	23105	23112	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_013949	CT	3	6	24341	24346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_013949	AAAT	2	8	24355	24362	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013949	TATT	2	8	24380	24387	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013949	CT	3	6	24396	24401	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_013949	AT	4	8	24420	24427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013949	ATA	2	6	24459	24464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013949	CTG	2	6	24492	24497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_013949	AGAA	2	8	24519	24526	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013949	CTT	2	6	24535	24540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_013949	TGGAA	2	10	24591	24600	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013949	GAGG	2	8	24606	24613	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013949	GCTTG	2	10	24669	24678	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_013949	TAG	2	6	24748	24753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013949	TTTC	2	8	24761	24768	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_013949	TGC	2	6	24872	24877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_013949	ATT	2	6	24885	24890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013949	GCG	2	6	24950	24955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_013949	CCAC	2	8	25011	25018	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
88	NC_013949	TAAT	2	8	25089	25096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013949	CTT	2	6	25139	25144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_013949	AAG	2	6	25422	25427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013949	AGG	2	6	25436	25441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013949	TTTG	2	8	29806	29813	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013949	TCCCT	2	10	29892	29901	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
94	NC_013949	GA	3	6	29912	29917	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013949	A	6	6	29917	29922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013949	TCT	2	6	29932	29937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_013949	TCA	2	6	29961	29966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_013949	GAA	2	6	29991	29996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013949	T	6	6	30024	30029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013949	TTTG	2	8	30059	30066	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013949	T	6	6	30082	30087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013949	CTC	2	6	30737	30742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_013949	T	6	6	30743	30748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013949	ATT	2	6	30755	30760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013949	T	6	6	30775	30780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013949	T	6	6	30829	30834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013949	GTT	2	6	30843	30848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013949	A	6	6	30881	30886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013949	A	7	7	30894	30900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013949	T	8	8	33038	33045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013949	TAT	2	6	33052	33057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013949	TAT	2	6	33067	33072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013949	T	6	6	33093	33098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013949	GGA	2	6	33099	33104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013949	TTG	2	6	34504	34509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013949	A	6	6	34594	34599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013949	A	6	6	34681	34686	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013949	AGT	2	6	34728	34733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013949	A	6	6	34757	34762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013949	AGT	2	6	34769	34774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013949	CAA	2	6	35950	35955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_013949	AGA	2	6	35966	35971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013949	A	7	7	35983	35989	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013949	CAA	2	6	35992	35997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_013949	T	6	6	36015	36020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013949	A	6	6	36066	36071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013949	ATC	2	6	36076	36081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_013949	TGA	2	6	36087	36092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013949	A	6	6	38232	38237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013949	T	7	7	38253	38259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013949	GACT	2	8	38371	38378	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_013949	T	6	6	38388	38393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013949	CTT	2	6	38445	38450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_013949	T	6	6	42266	42271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013949	GAT	2	6	42272	42277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013949	CAA	2	6	43736	43741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_013949	GA	3	6	43819	43824	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013949	GT	3	6	43838	43843	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013949	GA	3	6	43844	43849	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013949	GTGG	2	8	43897	43904	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013949	TGC	2	6	43947	43952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_013949	A	6	6	44059	44064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013949	TGA	2	6	44093	44098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013949	TCT	2	6	44149	44154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_013949	GC	3	6	44155	44160	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_013949	ATG	2	6	44161	44166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013949	T	7	7	44198	44204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013949	TCC	2	6	44215	44220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_013949	T	6	6	45536	45541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013949	TG	3	6	45570	45575	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_013949	TTA	2	6	45584	45589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_013949	GAA	2	6	47906	47911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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441	NC_013949	GCA	2	6	125247	125252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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445	NC_013949	AGA	2	6	125342	125347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
446	NC_013949	CAG	2	6	125390	125395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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448	NC_013949	AGGT	2	8	125536	125543	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
449	NC_013949	GTT	2	6	125700	125705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
450	NC_013949	GAA	2	6	125844	125849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
451	NC_013949	TGC	2	6	125925	125930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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461	NC_013949	CCT	2	6	126404	126409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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463	NC_013949	GGT	2	6	126537	126542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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465	NC_013949	AGG	2	6	126649	126654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
466	NC_013949	CCA	2	6	126679	126684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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471	NC_013949	TAT	2	6	126879	126884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NC_013949	TAA	2	6	126903	126908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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476	NC_013949	AAG	2	6	127125	127130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_013949	TAG	2	6	127339	127344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
482	NC_013949	GAT	2	6	127394	127399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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486	NC_013949	TGC	2	6	127798	127803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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488	NC_013949	GGA	2	6	127861	127866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
489	NC_013949	CAAA	2	8	127923	127930	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
490	NC_013949	AT	3	6	127957	127962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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499	NC_013949	AGA	2	6	128320	128325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
500	NC_013949	ACCA	2	8	128535	128542	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

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